通用引物為啥會有引物特異性問題?
1樓:優秀如你
通用引物為啥會有引物特異性問題的原因:
引物設計要在基因序列的保守區域內。保守區域就是生物體進化過程中基本保持不變的 dna 分子中的乙個核苷酸片段或者蛋白質中的氨基酸片段,可以通族擾汪過比對不同物種間相似序列得到。這樣不管你李大是做全新的基因,還是設計多個物種的通用引物,都可以在一定程度上保證引物的可用性。
引物長度一般在20個鹼基左右。引物長度過長,則會導致延伸溫度過高,不利於taq酶反應;如果過短,則會導致引物特異性太差,出現非特異性擴增,甚至發生誤把別的基因片段檢成目的片段的情況。
gc含量在40-60%左右。gc含量過低,引物的tm值就會跟著低,退火溫度低了就不利於pcr的特異性反應;gc含量兆仔過高則會導致解鏈難度增大,可能會出現因模板解鏈不充分導致的非特異性擴增。
通用引物和特異性引物的區別
2樓:巧希榮委媼
已細菌為例,通用引物就是對所有種類的細菌都通用,即用通用引物可以pcr擴增所有缺祥細告扮虧菌的某段dna,特異襪神性引物只能用於某種或某類細菌dna的pcr擴增。
引物有正向引物和反向引物嗎?
3樓:不乖的
正向引物和反向引物是相對的,通常以乙個雙鏈dna(上面的那條鏈)的上游結合部位稱為正向引物,並運老是從左到右的方向,也就是5-3的方向,而下面那條互補鏈的下游結合部位稱為反向引物。
其方向是從右到左的,因為下面的鏈的方面從左到右是3-5,從右到絕公升左就是5-3了,pcr的擴增的確是一條引物就可以擴增了。
反向引物的存在可以結合互補鏈,使互補鏈的擴增方向也是5-3,這樣一次就是兩條鏈同時擴增,迴圈一次就是4條鏈同時擴增再迴圈一次就是8條鏈同時擴增,這樣才是所謂的幾何級數擴增。
正向合成時延伸到反向引物結合位點時就會停止,同理反向引物也是。
什麼叫引物?引物分為正向引物和反向引物?
4樓:生活小學問
正向引物,反向引物。
引物自身及引物虧磨之間不應存在互補序列。連續互補的鹼基應該要少於4 個。引物應使其g值不要太高,g值越大,則雙鏈越穩定。
引物長度和gc 含量要適中。引物長度大概為18~28 bp,但不應大於38 bp,引物過短會影響到擴增的特異性,太長的話其延伸溫度將會大於74 ℃,不利taq 酶的催化反應。若擴增產物為4~5 kb,引物最好不要少於24bp。
5樓:洛心書
引物(primer)是在分子生物學實驗中常用的短片段單鏈dna或rna,通逗帶兄常由15-30個核苷酸組成。引物在實驗過程中起到特異性結合目標dna或rna模板的作用,併為dna或rna聚合酶提供起始位點,行攔從而引導聚合酶進行核酸的合成。
在聚合酶鏈反應(pcr)等實驗中,引物通常分為正向引物(forward primer)和反向引物(reverse primer)。正向引物和反向引物的主要區別在於它們結合目標dna模板的方向。
正向引物與目標dna模板的正鏈(也稱為感應鏈,5' -3'方向)互補結合,從而引導dna聚合酶在3' -5'方向進行新鏈的合成。反向引物與目標dna模板的負鏈(也稱為反式鏈,3' -5'方向)互補結合,引導dna聚合酶在5'山襲 - 3'方向進行新鏈的合成。
通過使用正向引物和反向引物,pcr實驗可以在雙鏈dna模板的兩條鏈上特異性地擴增目標片段。這種方法在基因轉殖、基因表達分析、基因等領域具有廣泛的應用。