如何查詢某一基因的啟動子區有無某轉錄因子的結合位點

時間 2021-09-06 19:12:48

1樓:匿名使用者

查詢某一基因的啟動子區有無某轉錄因子的結合位點可嘗試用缺失分析,應先用matinspector **有無轉錄因子結合位點的存在,然後將啟動子區域轉殖,構建一系列區域突變轉殖,與基因編碼轉錄因子的基因共表達,檢測報告基因的表達,來判斷轉錄因子的結合位點。

轉錄因子,真核生物轉錄起始十分複雜,往往需要多種蛋白因子的協助,轉錄因子與rna聚合酶ⅱ形成轉錄起始複合體,共同參與轉錄起始的過程。根據轉錄因子的作用特點可分為二類;第一類為普遍轉錄因子,它們與rna聚合酶ⅱ共同組成轉錄起始複合體時,轉錄才能在正確的位置開始。除tfⅱd以外,還發現tfⅱa,tfⅱf,tfⅱe,tfⅱh等,它們在轉錄起始複合體組裝的不同階段起作用。

第二類轉錄因子為組織細胞特異性轉錄因子,這些tf是在特異的組織細胞或是受到一些類固醇激素\生長因子或其它刺激後,開始表達某些特異蛋白質分子時,才需要的一類轉錄因子

2樓:檢驗教研室

這個目前好像還查不到吧,只有查文獻看別人的報道。因為如果可以根據結構或功能域去查的話,很多訊號通路的研究都不用那麼複雜了

如何在網上查某個基因的轉錄因子及啟動子

3樓:曉鶯殘歲月

查詢某一基因的啟動子區有無某轉錄因子的結合位點可嘗試用缺失分析,應先用matinspector **有無轉錄因子結合位點的存在,然後將啟動子區域轉殖,構建一系列區域突變轉殖,與基因編碼轉錄因子的基因共表達,檢測報告基因的表達,來判斷轉錄因子的結合位點。

轉錄因子,真核生物轉錄起始十分複雜,往往需要多種蛋白因子的協助,轉錄因子與rna聚合酶ⅱ形成轉錄起始複合體,共同參與轉錄起始的過程。根據轉錄因子的作用特點可分為二類;第一類為普遍轉錄因子,它們與rna聚合酶ⅱ共同組成轉錄起始複合體時,轉錄才能在正確的位置開始。除tfⅱd以外,還發現tfⅱa,tfⅱf,tfⅱe,tfⅱh等,它們在轉錄起始複合體組裝的不同階段起作用。

第二類轉錄因子為組織細胞特異性轉錄因子,這些tf是在特異的組織細胞或是受到一些類固醇激素\生長因子或其它刺激後,開始表達某些特異蛋白質分子時,才需要的一類轉錄因子

如何快速的找到轉錄因子和啟動子的結合位點

4樓:西北大學劉瑞

同乙個基因的啟動子都是可長可短的,只是不同長度可能啟動子的活性不一樣。真核生物一般都是認為在第一外顯子上游的2kb以內(也有2kb以外的)。轉錄因子不同的**方法(除了promo,還可用jaspar 、tfsearch、transfac等資料庫)結果都不一樣,最終只有實驗驗證的才準確。

5樓:

chip-seq

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如何通過酵母證明啟動子和轉錄因子結合

6樓:芬達甲

查詢某一基因的啟動子區有無某轉錄因子的結合位點可嘗試用缺失分析,應先用matinspector **有無轉錄因子結合位點的存在,然後將啟動子區域轉殖,構建一系列區域突變轉殖,與基因編碼轉錄因子的基因共表達,檢測報告基因的表達,來判斷轉錄因子的結合位點。

轉錄因子,真核生物轉錄起始十分複雜,往往需要多種蛋白因子的協助,轉錄因子與rna聚合酶ⅱ形成轉錄起始複合體,共同參與轉錄起始的過程。根據轉錄因子的作用特點可分為二類;第一類為普遍轉錄因子,它們與rna聚合酶ⅱ共同組成轉錄起始複合體時,轉錄才能在正確的位置開始。除tfⅱd以外,還發現tfⅱa,tfⅱf,tfⅱe,tfⅱh等,它們在轉錄起始複合體組裝的不同階段起作用。

第二類轉錄因子為組織細胞特異性轉錄因子,這些tf是在特異的組織細胞或是受到一些類固醇激素\生長因子或其它刺激後,開始表達某些特異蛋白質分子時,才需要的一類轉錄因子

求生物強人關於複製原點,標記基因,啟動子,終止子與啟動密碼子終止密碼子和目的基因的詳細關係

lni 冠文 複製原點 dna聚合酶的結合位點,複製的起點.標記基因,啟動子和終止子是基因工程的內容 在基因工程第二步 構建表達載體時,為了讓目的基因表達蛋白,而質粒上的其它基因盡可能的不表達,所以要求有啟動子和終止子.他們都分別是一段dna,啟動子是結合rna聚合酶的位點,終止子 轉錄的終止位點,...

啟動子和起始密碼子的區別,啟動子終止子起始密碼子終止密碼子區別

清溪看世界 一 作用不同 1 啟動子 活化rna聚合酶。2 起始密碼子 作為多肽鏈合成的起始訊號,同時編碼一種氨基酸 既編碼甲硫氨酸,又作為多肽鏈合成的起始訊號。二 原理不同 1 啟動子 含有rna 聚合酶特異性結合和轉錄起始所需的保守序列,多數位於結構基因轉錄起始點的上游,啟動子本身不被轉錄。2 ...

生物 起始密碼子與啟動子的區別,生物,啟動子 終止子 起始密碼和終止密碼,關係與區別?

拓碑渡口 起始密碼子就是從這個鹼基開始決定蛋白質合成,蛋白質是由許多氨基酸組成的,而組成蛋白質的第乙個氨基酸就是有起始密碼子決定的 你可以這樣理解 啟動子並不合成蛋白質,就是事先告訴你再過幾個鹼基就快要合成蛋白質了,做好準備,啟動子在起始密碼子之前,兩者之間還隔著一些鹼基,這之間的鹼基是不翻譯成氨基...